多くの生物は，睡眠・覚醒リズムや体温リズムといった
約２４時間周期の生理リズムを示す．地球の自転周期にあ
わせたこのような体内リズムはサーカディアン（概日）リ
ズムと呼ばれ，体内に存在する自律振動体であるサーカ
ディアンクロック（概日時計）によって生み出される．

概日時計は，外界からの周期的な刺激がない一定の条件にお
いても，長い期間にわたって自律的に振動を続ける強固性
（ロバストネス）を持ちながら，外界の刺激に応答して時
刻を調節する柔軟性を持ちあわせる．

　生物が示すリズム現象についてはかなり古くから生理学
的な研究がなされてきた．一方，１９９７年に clock 変異体の
ポジショナルクローニングによって Clock 遺伝子が同定さ
れた．これを皮切りに，概日時計の分子メカニズムの解明
が急速に進んだ．

　概日時計システムが，２４時間という長い時間を正確に刻むために「タンパク質の翻訳後修飾」は
きわめて重要である．

　　 概日時計の発振メカニズム

１）分子時計の中心ループ
概日時計の発振メカニズムの基本骨格は，時計遺伝子の転写と翻訳を介したネガティブフィードバックループであ
り，下等生物から高等生物まで広く保存されている．哺乳類においては，正の転写因子である CLOCK-BMAL１が E-box 配列に結合し，E-box エンハンサーによって転写活性化される Period（Per１～３）と CryptochromeCry１２遺伝子の転写を促進する．このように転写・翻訳された PER と CRY タンパク質は細胞内でゆっくりと時間をかけて蓄積し，PER-CRY 複合体を形成して核内に移行する．負の因子である PER-CRY 複合体は，CLOCK-BMAL１による転写活性化を抑制してネガティブフィードバックループを形成する．転写抑制の役目を終えた PER-CRY複合体は，核内で分解されて減少し，CLOCK-BMAL１による次のサイクルの転写活性化が再び起こる．

一日に１回，CLOCK-BMAL１による転写が活性化されることにより，約２４時間を周期としたさまざまな遺伝子の発現リズムが生み出される．

２）タンパク質修飾による時計タンパク質の制御翻訳後修飾による時計タンパク質の精密な制御が，概日時計の発振において重要な役割を果たすことは疑いようがない．今から２５年も前に，２４時間よりも短い異常な周期の行動ズムを示す tau 変異ハムスターが発見されたが，２０００年に tau 変異がカゼインキナーゼ I（CKI）の活性変異によると証明された１）さらに，ヒトの睡眠位相症候群（familial advanced sleep phase syndrome: FASPS）の原因遺伝子変異がヒト PER２タンパク質のリン酸化部位Ser６６２の変異であることも示された２）これらの発見により，当該研究分野において，リン酸化を中心とした翻訳後による時計タンパク質の制御がにわかに脚光を浴びた．

　　 ユビキチン化による時計タンパク質の分解

１）ユビキチン化によるタンパク質の制御
ユビキチンは，７６アミノ酸残基からなる小さなタンパク質である．ユビキチンの C 末端カルボキシ基は，基質タンパク質側のリシン残基の側鎖アミノ基とイソペプチド結合を形成して基質タンパク質を修飾する．基質に結合したビキチンの分子内のリシン残基または N 末端のアミノ基に次のユビキチンが結合し，ポリユビキチン鎖が伸長する．基質特異性を決定する E３リガーゼは，哺乳類では約１，０００種類も存在する．一方，ユビキチン化反応は可逆的であり，ユビキチン鎖の除去やプロセッシングを行うユビキチン化酵素も１００種類ほどある．タンパク質リン酸化と同様，ユビキチン化による基質タンパク質の制御も多岐にわたる．最も古くから研究が進んいるのは，ユビキチン―プロテアソーム系によるタンパク質の分解である．これに加え，近年ではシグナル伝達やタンパク質の局在制御にもユビキチン化修飾が関与することが明らかになってきた．このように多彩なユビキチン化の制御は，ユビキチン分子がどのような結合様式の鎖を形成するかに依存する．たとえば，ユビキチンの４８番目のリシン残基（K４８）に結合してゆくポリユビキリン鎖は，プロテアソームにより認識されるため分解シグナルとして機能する．一方，K６３や M１（N 末端のメチオニン残基）を介して生成するユビキチン鎖は，ユビキチン結合ドメインを持つタンパク質を集める足場となってシグナル伝達を制御する．

２）時計タンパク質のユビキチン化研究の始まり
リン酸化による PER タンパク質制御の発見から少し遅れて，２００２年，ハエの dPER タンパク質のユビキチン化
を担う E３リガーゼ Slimb が同定された

３，４）dPER はタンパク質キナーゼ Doubletime（前述の CKI のハエホモログ）によってリン酸化されることが知られており，Slimb はあらかじめリン酸化された dPER を認識して dPER をユビキチン化する．Slimb の機能欠失変異体においては，PER の発現リズムと行動リズムが消失する．興味深いことにアカパンカビにおいても，CKI または CKII 依存的にリン酸化された負の制御因子 FREQUENCY は，Slimb のホモログFWD１によってユビキチン化される

５）哺乳類においても，Slimb のホモログである -TrCP によって PER１と PER２がユビキチン化されて分解される

６）つまり，ユビキチン化による負の因子の分解制御は幅広い種を超えて保存されている．基質である FRQ と PER には相同性がないにも関わらず，その分解制御を担うキナーゼと E３リガーゼが保存されていることは興味深く，リン酸化とユビキチン化による時計タンパク質の制御機構が概日時計システムの中でいかに重要であるかがわかる．

４． FBXL３による CRY タンパク質の分解制御
時計タンパク質の中において，PER タンパク質は一日を通してタンパク質量が顕著に概日変動する．さらに，リ
ン酸化―ユビキチン化による分解制御の知見が早くから蓄積していたことから，PER タンパク質の量的制御に注目
が集まっていた．その中で，２００７年，三つのグループから，哺乳類 CRY１・２の E３リガーゼとして FBXL３が発見された７～９）そのうち二つのグループは，変異体スクリーニングにより長周期の行動リズムを示すマウスを単離し，その原因遺伝子 Fbxl３ を同定した．FBXL３の点変異により，概日リズム周期が異常に長くなるだけでなく，E-boxに制御された遺伝子群の転写が顕著に減少する７）また，低分子化合物ライブラリーなどを使用した大規模スクリーニングにより，細胞時計の周期を延長させる薬剤 KL００１が同定された１０）この薬剤は CRY１・２の FBXL３結合部位である FAD 結合ポケットをターゲットとしている．そのため，KL００１による FBXL３と CRY 結合の阻害が CRY の安定化をもたらし，細胞リズム周期を延長する．さらに，FBXL３は，基質である CRY 依存的に E３リガーゼ複合体Skp-Cul１-F-box 複合体）を形成する，という F-box タンパク質の中ではきわめて特殊な性質を持つこともわかってきた１１）
．
５． FBXL２１による CRY タンパク質安定化
最近，我々と Joseph Takahashi らのグループは独立し 概日時計のネガティブフィードバックループPER-CRY 複合体は CLOCK-BMAL１の転写活性化を負に制御することにより，自身の転写を抑制する．一群の時計タンパク質は，一日を通してリン酸化やユビキチン化などさまざまな翻訳後修飾を受ける．FBXL３の相同タンパク質である FBXL２１による CRY新規制御メカニズムを発見した１２，１３）FBXL２１は CRY１と CRY２をユビキチン化して，意外なことに CRY を安定化することがわかった．つまり，FBXL３と FBXL２１は互いによく似た E３リガーゼでありながら，同じ基質を分解あるいは安定化する，という逆向きの制御をすることが判明した．米国のグループは，短周期の行動異常を示す変異体スクリーニングから FBXL２１を同定した．一方，Fbxl３ と Fbxl２１ のノックアウトマウスの行動解析よりFBXL２１による CRY タンパク質の制御機構を発見した．Fbxl３ と Fbxl２１ のダブルノックアウトマウスでは，Fbxl３シングルノックアウトマウスの異常に長い周期性が大きく緩和（短周期化）して２４時間周期に近づいた（図２）．興味深いことに，一部のダブルノックアウトマウスにおいては恒暗条件に移してから数週間たつと行動リズムが消失した．つまり，FBXL３と FBXL２１による CRY１・２の不安定化と安定化の制御は，CRY タンパク質の適切な発現変動を生み出し，概日時計の振動を安定に保つと考えられた
（図３）．

時計タンパク質のユビキチン化を担う E３リガーゼの同定が進む中，脱ユビキチン化酵素の同定は遅れている．

現在のところ，哺乳類では USP２（ubiquitin specific protease２）が PER１，BMAL１と CRY１の脱ユビキチン化に関与していることが報告された１４～１６）が Usp２ ノックアウトマウスの行動リズムは野生型マウスと大きく違わないことから，概日時計を制御する未同定の脱ユビキチン化酵素が存在する可能性が高い．今後，E３リガーゼと脱ユビキチン化酵素による複雑なユビキチン化ネットワークを明らかにしてマウスの輪まわし行動を数週間にわたりモニタリングし，プロットした（横軸は時間，縦軸は測定開始からの日数）． 野生型マウスは約２３．５時間周期の行動リズムを示すため，活動の開始点が一日ずつ前にずれていく．Fbxl３ ノックアウトマウスはきわめて長い周期（約２８時間）の行動リズムを示すため，行動の開始点は一日ずつ後ろにずれていく．このようなFbxl３ 欠損マウスの長周期性は，Fbxl２１ の欠損によって大きく緩和されて２４時間に近くなる
．さらに，一部のマウスは行動リズムが消失する．
FBXL２１は細胞質で CRY を安定化し，CRY の蓄積を助ける．
一方， FBXL３は CRY を分解し，核内の CRY の消失を助ける．